Tomac1 Ahoj, promiň za pozdní odpověď - nějak mi to tu zapadlo 
Mělo by pomoct $dumperu nastavit enablePositionChanges() (viz https://github.com/inlm/schema-generator/blob/master/docs/sql-dumper.md) - pak by to mělo zachovávat pozice sloupců jak jsou v entitách.
Ono to aktuální chování, že se nové sloupce přidávají na konec vychází z toho, že na produkci je ti jedno jestli mají sloupce "tvoje" pořadí a pro databázi by mělo být teoreticky jednodušší přidat sloupec na konec, než někam "doprostřed" (odpadá tím přesouvání dat apod.).
